Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S3

Rasgrp1, RAS guanyl-releasing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp1Q9Z1S3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rasgrp1Q9Z1S3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rasgrp1Q9Z1S3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rasgrp1Q9Z1S3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgrp1Q9Z1S3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms