Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms