Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sfrp4Q9Z1N6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms