Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup160Q9Z0W3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup160Q9Z0W3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms