Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms