Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms