Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stxbp4Q9WV89 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms