Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms