Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpv2Q9WTR1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv2Q9WTR1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms