Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hic1Q9R1Y5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hic1Q9R1Y5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms