Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpc6Q9R087 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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