Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsjQ9R014 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtsjQ9R014 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms