Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Opn4Q9QXZ9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms