Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms