Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trp53inp1Q9QXE4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms