Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkl2Q9QUK0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms