Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc2lQ9JME7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms