Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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SacsQ9JLC8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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SacsQ9JLC8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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SacsQ9JLC8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SacsQ9JLC8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SacsQ9JLC8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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