Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms