Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upk3aQ9JKX8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms