Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pole3Q9JKP7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms