Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trem1Q9JKE2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trem1Q9JKE2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trem1Q9JKE2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trem1Q9JKE2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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