Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tuba8Q9JJZ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tuba8Q9JJZ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tuba8Q9JJZ2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Tuba8Q9JJZ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tuba8Q9JJZ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Tuba8Q9JJZ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tuba8Q9JJZ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms