Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gfra4Q9JJT2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfra4Q9JJT2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms