Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms