Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms