Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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