Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Usp29Q9ES63 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp29Q9ES63 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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