Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vmn1r44Q9EQ47 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms