Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpgrip1Q9EPQ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms