Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Clstn1Q9EPL2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clstn1Q9EPL2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms