Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrpraQ9DBG7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms