Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift43Q9DA69 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms