Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D9H8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms