Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Derl3Q9D8K3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms