Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp4bQ9D8B3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms