Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc3Q9D6Y1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc3Q9D6Y1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms