Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc94Q9D6J3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms