Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D5Q8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D5Q8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms