Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4f1Q9D5Q6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms