Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7Q9D541 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7Q9D541 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7Q9D541 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7Q9D541 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7Q9D541 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7Q9D541 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7Q9D541 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7Q9D541 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms