Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms