Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cfap53Q9D439 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms