Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syf2Q9D198 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms