Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spc24Q9D083 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms