Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nde1Q9CZA6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms