Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Exo5Q9CXP9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Exo5Q9CXP9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Exo5Q9CXP9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Exo5Q9CXP9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Exo5Q9CXP9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exo5Q9CXP9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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