Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Sgo1Q9CXH7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Sgo1Q9CXH7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Sgo1Q9CXH7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Sgo1Q9CXH7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Sgo1Q9CXH7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Sgo1Q9CXH7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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Sgo1Q9CXH7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sgo1Q9CXH7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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