Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms