Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NubplQ9CWD8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NubplQ9CWD8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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